Cell子刊：首个泛癌肿瘤微环境图谱，可准确预测免疫治疗疗效( 二 )

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图片来源：Cancer Cell
由于组织学上可以反应肿瘤微环境的相关表型，作者通过分析黑色素瘤肿瘤样本的组织染色进一步对 TME 亚型进行验证。研究者对 TCGA 中的患者的肿瘤组织 HE 染色彩色图像进行分析。结果显示，
肿瘤浸润淋巴细胞的比例在 IE/F 和 IE 类型的黑色素瘤和膀胱癌的肿瘤微环境中显著升高，提供了对不同肿瘤微环境分型的大型组织学的验证分析。同时进一步验证了模型的可行性
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2. 模型应用：四种 TME 亚型在多种不同癌症中普遍存在并与免疫治疗效果相关
为了确认模型在多种不同癌症中的应用，研究者分析了来自其他癌症类型的转录组数据，从而确定的四种 TME 亚型是否也存在于其他癌症类型中。结果显示，同样的基因表达的分类系统应用于 8024 个TCGA肿瘤队列中的多种肿瘤类型。最终，
此方法在跨多种癌症类型的 Fges 模式分析中复现了研究者在前期黑色素瘤中建立的 TME 四亚型分类系统和预后结果
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之前的研究认为对免疫治疗的响应，特别是对免疫检查点抗体阻断的治疗相应是和 T 细胞浸润程度相关。为了确定这种 TME 分类系统是否可以作为预测免疫治疗响应的工具，研究者研究了四种不同的 TME 亚型对免疫检查点抑制剂的反应。研究者发现， TME 分类系统可以作为一种生物标志物应用于免疫治疗的响应预测。
这些分析明确的证明了 TME 分类平台与患者生存率相关的能力，并揭示了其作为多种癌症免疫疗法通用生物标志物的潜力
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近期的研究指出， TME 可以直接影响免疫检查点封锁的效果。同时，免疫疗法治疗后同时也可以影响和改变 TME 。因此，追踪 TME 的演化过程可以深入了解免疫治疗的作用对象并提供重要的临床治疗信息。研究者通过收集黑色素瘤接受 PD-1 阻断抗体治疗的患者，分析患者治疗前后的活检组织的转录组测序结果发现：对免疫治疗有反应的黑色素瘤患者的肿瘤 TME 为免疫丰富的亚型 IE 和 IE/F ，而无反应的患者则是免疫不利的亚型 F 。提供了为临床治疗患者通过活检获得的信息，准确预测免疫治疗反应和适当更替治疗策略的可能。