如何利用组学工具快速切入临床科学问题形成科研思路？( 二 )

影响因子：IF=2.977
科学问题：在抑郁症中已经发现了神经元丢失，但其机制尚未完全了解。利用蛋白质组分析探索这种病理变化的潜在机制。
研究内容
1. 模型评估：慢性不可预测的轻度应激(CUMS)处理小鼠2个月。对其抑郁样和焦虑样症状的行为评估以及认知症状的行为评估，表明抑郁症模型建立成功。
2. 蛋白质组分析：对抑郁症和健康组照模型小鼠的海马区组织进行蛋白质组分析，海马体中的4625个蛋白质被鉴定， 4046个蛋白质被定量。与对照组相比， CUMS组在1.5倍变化(> 1.50或< 0.67)和p值< 0.05的基础上获得47个差异表达的蛋白质。在这些显著改变的蛋白质中， 27个蛋白质被上调， 20个被下调。对显著失调的蛋白质进行对其进行GO、KEGG、亚细胞定位分析。其中最显著富集的KEGG途径是矿物质吸收、坏死性下垂、基底切除修复、系统性红斑狼疮和铁下垂。
3. 差异蛋白验证：免疫荧光证实，与对照组相比，海马CA1和DG亚区的神经元损失显著。对RIP3、MLKL和p-MLKL及与铁稳态失调和脂质过氧化相关指标，包括Ftl1、MDA、GSH和GPX4等进行WB验证，结果表明铁死亡和坏死与慢性应激诱导的抑郁有关。

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案例一
Small intestine proteomics coupled with serum metabolomics reveal disruption of amino acid metabolism in Chinese hamsters with type 2 diabetes mellitus.

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影响因子：IF=3.509
科学问题：2型糖尿病（T2DM）是一种以高血糖症为特征的代谢紊乱，伴有代谢紊乱，胰岛素抵抗（IR），其机理研究通常是基于啮齿动物模型。中国仓鼠有自发性T2DM非肥胖动物模型的特征，用于研究糖尿病发病机理和分子机制的潜在价值。
研究内容
1. 模型评估：中国仓鼠是T2DM的自发模型，从三个月大的血糖变化开始，在12个月大时开始患上糖尿病。比较糖尿病仓鼠和非糖尿病的对照组，结果显示糖尿病仓鼠空腹血糖（FBG）水平高于对照组， OGTT结果显示，在30min时，糖尿病仓鼠糖耐量明显受损。
2. 蛋白质组分析：对糖尿病仓鼠小肠组织样本进行蛋白质组学分析，对213个差异蛋白进行亚细胞定位、COG和GO分析。差异蛋白质中的大多数在翻译后修饰、蛋白质周转、伴侣和氨基酸转运以及代谢中起作用。
3. 代谢组学分析：同时对糖尿病仓鼠的血清进行代谢组学分析，并对差异代谢物进行KEGG分析，谷胱甘肽代谢、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成以及精氨酸和脯氨酸代谢通路发生显著异常。