如何利用组学工具快速切入临床科学问题形成科研思路？
蛋白质组作为重要的科研技术 ， 广泛应用于科研中 ， 在每年数万篇论文中发挥重要作用 。 如何利用组学工具快速切入临床科学问题形成科研思路 ， 为我们的研究提速？可参考以下三种研究思路：
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- 蛋白质组学检测
- 分析差异蛋白 ， 对差异蛋白进行GO和KEGG分析
- 筛选差异蛋白进行表达量验证
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- 蛋白质组学和代谢组学检测
- 分析差异蛋白 ， 对差异蛋白进行GO和KEGG分析；分析差异代谢物 ， 对其进行KEGG分析
- 蛋白质组+代谢组数据整合
- 对关键通路中的蛋白进行验证
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- 蛋白质组学检测
- 分析差异蛋白 ， 对差异蛋白进行GO和KEGG分析
- 筛选差异蛋白进行表达量验证
- 对验证过的差异蛋白进行表达量干扰
- 细胞学实验
- 动物学实验
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案例一
iTRAQ-based quantitative proteomics analysis of immune thrombocytopenia patients before and after Qishunbaolier treatment.（客户案例）
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影响因子：IF=2.2
科学问题：确定齐顺保利尔（QSBLE）治疗免疫血小板减少症（ITP）的潜在治疗靶点 。
研究内容
1. 蛋白质组学：利用蛋白质组学对ITP病患者（对照3重复 ， 治疗有效、无效病人治疗前后各3重复） ， 治疗在QSBLE治疗前后的蛋白质表达差异进行分析 。 与对照组相比 ， 共鉴定出982种差异表达蛋白 。 与治疗前相比 ， 治疗后61种蛋白表达差异 ， 其中48种蛋白显著上调 ， 13种蛋白下调 。 29条差异途径显著富集 。
2. 差异蛋白验证：Q6N030和其他蛋白质是蛋白质通路网络中的关键成员 ， 并挑选了20种与免疫相关的蛋白质 ， 采用RT-PCR和WB进行验证 ， 研究证实经QSBLE处理后 ， ITPs中MIF、PGK1和IGHM上调 。
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案例二
Hippocampal proteomic analysis reveals activation of necroptosis and ferroptosis in a mouse model of chronic unpredictable mild stress-induced depression.
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