又一个肿瘤免疫浸润分析利器

作者：医学数据库百科
关于TCGA表达数据的分析。之前我们我们介绍过。目前可能用的最多的也就是GEPIA了。之前在GEPIA2发表的时候(GEPIA I, GEPIA II) ，我们对这个数据库进行了介绍。最近。 GEPIA的团队发表了一个对免疫细胞进行相关分析的数据库—GEPIA2021(http://gepia2021.cancer-pku.cn/) ，所以今天就来给大家介绍一下。这个GEPIA2021是干啥的吧。

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背景数据集和GEPIA数据库一样，这个数据库也是使用TCGA/GTEx当中表达的数据来进行后续分析的数据库。
和GEPIA不同的是， GEPIA是用来分析在两个TCGA/GTEx当中基因的变化情况的。而在GEPIA2021当中，主要是用来分析免疫细胞在目标组织当中的变化的。
这个方面和TIMER数据库有点儿类似，不过使用的算法不同。在在GEPIA2021当中，主要是作者使用三种算法来评价了组织当中的免疫细胞(CIBERSORT, EPIC, quanTIseq) 。因此如果想用这三种算法来分析TCGA/GTEx数据库当中的免疫细胞的话，可以使用GEPIA2021 。

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数据库使用在这个数据库当中，总共分成了四个部分的分析。
1. 免疫细胞比例分析在这个部分，我们可以分析不同的组织当中免疫细胞比例。我们需要做的就是选择想要分析的组织已经想要分子的免疫细胞即可。

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例如我们想要分析在乳腺癌当中基于CIBERSORT算法得到的两种B细胞的变化。

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在选择好之后，点击plot即可得到相关的结果。
结果主要包括两个部分，一个是相同的组织当中免疫细胞比例是否存在差别。另外一个是在相同的免疫细胞在不同的组织当中是否存在差别

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2.相关分析在相关分析当中，主要用来分析组织当中候选免疫细胞是否有区别。在这个部分，如果选择多种组织的话，也是把这些组织的表达水平融合到一起分析的。

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这一部分的结果主要是通过散点图来进行呈现的。同时对于不同的组织使用不同的颜色进行区分。同时在结果当中给出了相关分析的相关系数。

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