微生物领域最新研究成果盘点（20210603）( 四 )

摘要：通过4年时间对338名受试者的肠道微生物组、51种人类表型和1183种代谢物的血浆水平进行随访，本文研究了微生物的稳定性和与宿主生理学的关系。利用这些个体特异性和暂时稳定的微生物图谱，包括细菌单核苷酸多态性（SNPs）和结构变异，本文开发了一种微生物指纹图谱方法，显示了高达85%的准确率分类4年内收集的宏基因组样品。应用本文的指纹分析方法对独立的Lifelines-DEEP队列进行分析，结果显示，间隔1年的样本准确率为95% 。进一步研究了多种细菌物种丰度、代谢途径和结构变化以及菌株替换的时间变化。本文还报告了190个与宿主表型相关的纵向微生物和519个与血浆代谢物相关的纵向微生物。这些关联丰富了心脏代谢特征、维生素B和尿毒症毒素。最后，通过调解分析表明，肠道微生物群可能通过其代谢物影响心脏代谢健康。
关键词：细菌遗传学；人体肠道微生物群；人体代谢；个体特异性；纵向研究；宏基因组学；人群队列研究。

原名：The long-term genetic stability and individual specificity of the human gut microbiome
译名：人类肠道微生物组的长期遗传稳定性和个体特异性
期刊：Cell
IF：38.637
发表时间：2021年4月9日
通讯作者：Alexandra Zhernakova和Jingyuan Fu
通讯作者单位：荷兰格罗宁根大学遗传系
DOI号：10.1016/j.cell.2021.03.024
原文链接：
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867421003524?via%3Dihub#undfig1

本文插图

图文摘要
科研| Cell Host & Microbe：重新思考噬菌体-细菌-真核生物的关系及其对人类健康的影响
本文由艾奥里亚编译
德国慕尼黑理工大学（Technical University of Munich）的Adam Wahida与南京农业大学（Nanjing Agricultural University）的汤芳于2021年03月17日共同在Cell Host & Microbe发表题为《Rethinking phage-bacteria-eukaryotic relationships and their influence on human health》的文章，并担任通讯作者。人体中栖息着大量的微生物，这些微生物包括共生细菌（机体微生物菌群的主要成分）以及细菌病毒（通常被称为噬菌体）。越来越多的研究表明，噬菌体及其细菌宿主和人类宿主所形成的三方相互作用，可以对人体的健康和疾病状态造成影响。该综述中，笔者聚焦于最近的一些研究进展，展示了噬菌体可以影响细菌和哺乳动物宿主的不同且经常令人惊讶的方式，重点放在三方相互作用机制上。这些相互作用即可以通过直接的方式（通过噬菌体对细菌的生态位造成影响），也可以通过更间接的途径（如影响新陈代谢和免疫系统）发生。了解这些机制以及它们如何在身体的不同部位发挥作用，对于未来利用微生物疗法管理我们的健康具有十分重要的意义。