由单细胞层面探究鼻咽癌的肿瘤异质性和细胞间的互作网络( 五 )

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接下来作者使用常规的分群将这些细胞分成了五个亚群，并且使用了GSVA来计算每个细胞的通路评分。然后通过差异分析找到每个亚群中的差异通路。这也是可以说明细胞间的异质性的一种方法。

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NPC中不同细胞间的通讯
既然上面作者在多个亚群分析里面都或多或少的提了配受体基因的高表达，所以在这一part ，作者就详细讨论了细胞亚群之间的配受体通讯。作者使用了CellPhoneDB进行了统计分析。接下来就是详细的描述这些通讯关系了，比如作者观察到DC_C3_LAMP3细胞、Treg细胞和耗竭CD8T细胞(CD8_C11_PDCD1)通过抑制性、共刺激分子或趋化因子之间的密集细胞相互作用，再比如DC_C3_LAMP3细胞亚群可以通过CCL17-CCR4和CCL22-CCR4与PBMC中的Treg_C1_SELL细胞相互作用， CCR4通过将Treg细胞招募到肿瘤组织。 Treg_C4_TNFRSF4细胞的CTLA4、ENTPD1和CSF1表达很高，这表明DC_C3_LAMP3细胞上的配体受体与CD80/CD86、ADORA2A和SIRPA结合，可以说明 Treg_C4_TNFRSF4和DC_C3_LAMP3细胞之间有潜在的相互作用。总而言之，根据细胞间通讯可以得到很多有用的信息的，对于了解不同细胞亚群间的互作网络是十分有帮助的。

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总结
通过对NPC队列进行单细胞免疫组测序，基于细胞亚群的再分群，然后对逐个细胞亚群细致的描述与挖掘，结合不同的分析手段（拟时序、GSVA、差异分析、细胞通讯分析）与TCR信息共同验证结论，鉴定了对鼻咽癌肿瘤发生过程中重要的细胞亚群和分子、CDR3序列，把对于鼻咽癌肿瘤的研究推向了更加精细的单细胞层面。
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