全球首次60个城市大检测：上万种未知的病毒细菌和我们一起挤地铁

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对于在威尔康奈尔医学院（Weill Cornell Medicine）的三年级学生Heba Shaaban来说，她的体验非同寻常：她和同事们在全世界不同城市的地铁、公车中，找到了成千上万种不为人知的细菌、病毒；并且注意到，就像每个城市拥有标志性的建筑一样，每个城市还有独特的微生物组成。

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▲Heba Shaaban和Christopher Mason教授在纽约地铁用棉签收集研究样品（图片来源：参考资料[2]；Credit: Images courtesy of Dr. Mason）
事实上，从2015年到2017年的3年时间里，为了检测城市里有哪些微生物，国际MetaSUB联盟的研究人员和志愿者在全世界六大洲的60个城市，包括上海、香港、台北等，从地铁的售票窗口、座位、扶手、车站地面等表面（少数没有地铁的城市，则以火车或公车代替），收集了近5000份样本。他们目前已发现了12000多种过去未知的微生物。近日，他们的分析结果在顶尖学术期刊《细胞》上发表。
“你每次坐地铁时，都可能有一个全新的物种和你一起通勤。 ”这项研究的通讯作者Christopher Mason教授说。

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▲数百名研究人员参与了这项国际研究（截图来源：《细胞》官网）
对于收集到的样本，研究人员采用了下一代测序法（NGS）基因组测序技术进行了分析，可以检测出各种细菌、古细菌以及使用DNA作为遗传物质的病毒。这也是迄今为止，全球规模最大的城市微生物宏基因组学研究。分析结果显示，除了4000多种已知的微生物外，有10928种病毒和748 种细菌是在任何参考数据库中都没有的新物种。
“我们不用惊慌，其中大多数不是病原体，大部分可能是无害的，有些实际上可能是有益的。 ”未参与这项研究的一名微生物学家Noah Fierer博士评论说。
研究人员指出，密切关注城市微生物组的变化将会提供有益的信息，比如有助于在爆发大规模疾病之前识别出先兆。

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▲该研究示意图（图片来源：参考资料[1]）
一项有趣的发现是，有31种细菌在绝大多数城市中都可以找到，研究人员称它们为“核心城市微生物物种”；但除此之外，每个城市都有其独特的微生物组合，例如沿海城市的样本中可能包含嗜盐微生物，来自人口稠密城市的样本可能显示出惊人的生物多样性。