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图6 不同放牧方式下 ， 季节间食物多样性和肠道微生物多样性的Bray–Curtis不相似性分析 。 行显示了不同季节食物组成（a和b）和肠道微生物群落（c和d）的差异 。 每一列对数据进行组织 ， 以便食物组成和肠道微生物群落组成的Bray-Curtis不相似性代表了季节性迁移放牧（a和c）和自由放牧（b和d） 。 所有boxplot分布均采用非参数Kruskal–Wallis和Wilcoxon进行分析 ， 并用FDR（错误发现率）修正p值 ， 中心值表示中间值和误差栏 ，*p<0.05 ， **p<0.01 ， ***p<0.001 。5 以Akkermansia和uncultured Eubacterium WCHB1-41为代表的潜在的冷适应性肠道类型和功能背景基于肠型能够反应出功能性差异的报道 ， 我们研究了牦牛肠道微生物群落是否能够根据季节性饮食差异划分为功能性不同的群 。 主成分分析（PCA）显示样本基于BC差异分析形成了三个不同的肠型 。 每个肠型由其代表性菌属的变化驱动：肠型1为Akkermansia和 uncultured Eubacterium WCHB1-41 ， 肠型2为Ruminococcaceae_UCG-005 ， 肠型3为Ruminococcaceae_UCG-010（图7a ， d-g；图S9, 10） 。 在TH和OCG中 ， 不同季节的肠型有变化 。 肠型1主要出现在寒冷季节（春季、秋季和冬季） ， 肠型2主要出现在温暖季节（夏季）（图7b、c；p<0.05 ， Fisher’s exact test）和肠型3在全年都出现（图7b ， c） 。 本研究识别了了高原牦牛不同肠型的季节分布 。

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图7 使用Bray-Curtis不相似性分析与季节有关的牦牛肠道菌群的肠型分布 。 牦牛肠型的鉴定见图S9 。 （a）肠型的可视化 ， 以PAM聚类所确定 。 每个肠型对应的属是通过它们的相对丰度来确定的（见图S10） 。 （b）和（c）分别表示春季、夏季、秋季和冬季季节性迁移放牧和自由放牧条件下各肠型的样本比例 。 （d）~（g）每种肠型细菌分类群的相对丰度 。 根据它们对整体Bray–Curtis不相似性的平均贡献 ， 选择了10个属 。 所有六个细菌属展示在图S10中 。 颜色对应于肠型簇 。 所有条带分布均采用Fisher精确检验和FDR（错误发现率）修正的双尾p值（b和c）进行检验 。 用非参数Kruskal–Wallis和Wilcoxon检验所有箱线图分布 ， 用FDR校正p值 ， 中心值表示中间值和误差线（d~g） ， *p<0.05 ， **p<0.01 ， ***p<0.001 。 这些肠道肠型的季节性分布使我们推测 ， 以Akkermansia和 uncultured Eubacterium WCHB1-41