医学微生物专栏 | 近期最值得看的研究成果盘点（20210528）( 三 )

结论：与对照组相比，肝硬化与肠道微生物ARG基因负担高有关，它随着疾病的发展而恶化，可能与CKD和糖尿病不同。 ARG不受利福昔明的影响，并与住院和死亡相关。
关键词：腹水；肝性脑病；利福昔明；感染；机器学习

原名：Impact of Antibiotic Resistance Genes in Gut Microbiome of Patients with Cirrhosis
译名：抗生素抗性基因对肝硬化患者肠道菌群的影响
期刊：Gastroenterology
IF：17.373
发表时间：2021.4.20
通讯作者：Jasmohan S.Bajaj
通讯作者单位：美国弗吉尼亚联邦大学和中央弗吉尼亚退伍军人医疗保健系统肠胃病学、肝脏病学和营养学部
DOI号：10.1053/j.gastro.2021.04.013
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本文插图

图文摘要
Gut科研| Gut：饮食与肠道微生物间的相互作用对循环中TMAO浓度的影响：来自美国男性的纵向队列研究结果
本文由黑玉堂编译
肠道微生物能够代谢富含胆碱/ L-肉碱的食物（例如红肉）从而产生氧化三甲胺（TMAO），较高的TMAO循环水平与心血管事件风险增高和不良代谢状态密切相关。然而，既往有关微生物与TMAO的研究大都借助于实验性手段或生物信息学/生物化学方法，欠缺在普通人群中的相关研究。美国哈佛大学陈曾熙公共卫生学院Qi Sun教授等人于2021年4月29日在Gut发表题为《Interplay between diet and gut microbiome, and circulating concentrations of trimethylamine N-oxide: findings from a longitudinal cohort of US men》的队列研究，通过对307名健康男性间隔6个月收集的两次粪便和血液样本进行宏基因组和宏转录组等相关分析，证实了在普通人群中饮食和肠道微生物间相互作用对循环TMAO水平和心血管代谢健康状况的影响。

摘要：目的：肠道产生的氧化三甲胺（TMAO）被认为可能介导了红肉摄入和不良心血管代谢健康状态之间的关联。我们调查了在自由生活的个体中，肠道微生物是否会影响食物前体与TMAO浓度间的相关性，并对心血管代谢风险标志物造成影响。
方案：我们从“男性生活方式验证研究”（Men’s Lifestyle Validation Study）中，收集到了来自307名健康男性的成对粪便样本（n = 925）和血液样本（n = 473），两次样本收集间隔6个月。采用食物频率问卷和饮食记录对饮食情况进行反复评估。采用鸟枪法测序对粪便的宏基因组和宏转录组进行分析，确定微生物的分类和功能特征。
结果：TMAO浓度与整体微生物构成相关（PERMANOVA检验， p = 0.001）。多变量全分类关联分析发现了10种细菌，其丰富度与血浆TMAO浓度显著相关（FDR<0.05）。在一些个体中，习惯性摄入更多红肉和胆碱与更高的循环TMAO浓度显著相关（