1型糖尿病里程碑式研究,迄今最大规模基因组分析寻找致病因素


▎药明康德内容团队编辑
近日发表于《自然》杂志的一篇论文中 , 加利福尼亚大学圣地亚哥分校(UCSD)医学院的研究人员 , 在细胞水平上绘制出导致1型糖尿病发病的遗传变异基础 。 该研究第一作者Joshua Chiou博士表示:“这是找到治疗方法逆转病程并最终完全预防疾病的关键一步 。 ”
这项研究为外分泌胰腺在1型糖尿病发病机制中的作用提供了支持证据 , 确定了特定细胞类型中的遗传变异是1型糖尿病发病的重要因素;同时 , 强调了全基因组关联研究(GWAS)和单细胞表观基因组学(single-cell epigenomics)这两种方法 , 有助于理解复杂疾病的细胞起源 。

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1型糖尿病是一种慢性自身免疫性疾病 , 患者的免疫系统会错误地攻击自身胰岛β细胞 , 导致β细胞功能逐步受损和死亡 , 最终患者需要依赖外源性胰岛素来进行治疗 。 对于1型糖尿病遗传易感人群 , 在出现明显高血糖症状前 , 疾病已经开始发展 , 主要表现为自身抗体(抗胰岛素和抗胰腺抗体等)的出现和糖耐量异常 。 在这期间 , 胰腺中的β细胞基本上仍完好无损 , 这为干预和保存β细胞提供了一个至关重要的窗口 。
1型糖尿病比2型糖尿病少见 , 但其患病率正在上升 , 目前缺乏为高危人群预防1型糖尿病发病的方法 。

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图片来源:123RF
人们对1型糖尿病的发病机制了解甚少 , 包括自身免疫是如何被触发的 。 由于这种疾病具有很强的遗传性 , 因此近年来科学家开展了多项全基因组关联研究(GWAS) , 寻找可能有关的遗传密码差异 。 这种方法通过比较具有相同疾病或症状患者的整个基因组 , 已经确定1型糖尿病风险的遗传变异大部分位于基因组的非编码区 。
据报道 , 此次这支研究小组进行了迄今为止最大规模的1型糖尿病GWAS , 同时结合了单细胞表观基因组学(single-cell epigenomics)的分析方法 。 具体来说 , 他们一共分析了520,580个基因组样本 , 确定了69个新关联信号 。 接下来 , 绘制了胰腺和外周血细胞中的448,142个顺式调控元件(基因内或附近的非编码DNA序列)的表观基因组图谱 , 这一图谱详细描述了细胞中的基因如何以及何时打开和关闭 , 从而生产行使不同细胞功能的蛋白质 。

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▲某些 遗传变异调节的基因 具有特殊胰腺外分泌功能 , 影响1型糖尿病的发生风险(图片来源:参考资料[1])