肾为先天之本,肾阳为一身阳气之根本。若肾病日久伤阳，或他脏阳虚累及于肾，或高年肾亏，房劳过度等均可导致肾阳不足。肾位腰部，脉贯脊胫,肾阳虚衰，经脉失养，则腰脊膝胫酸痛乏力；肾阳不足，不能温养下焦，则身半以下常有冷感；肾与膀胱相表里，肾阳虚不能化气利水，水停于内，则小便不利，少腹拘急不舒，甚则发为水肿、脚气；若肾阳虚馁，膀胱失于约束，则小便反多，入夜阳消阴长，故夜尿尤频；若肾阳不足，水液失于蒸化，津不上承,则口渴不已，液聚成痰，则发为痰饮，舌质淡而胖，脉虚弱尺部沉细，皆为肾阳虚弱之象。
由此可见，肾阳不足，气化失司，水液代谢失常为本证的基本病机表现，临床可见腰痛脚软，身半以下常有冷感，少腹拘急，小便不利，或小便反多，人夜尤甚，阳痿早泄.舌淡而胖，脉虚弱，尺部沉细，以及痰饮，水肿，消渴，脚气，转胞等。
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3配伍意义
本方是为肾阳不足之证而设，故以补肾助阳为法，“益火之源，以消阴翳”，铺以利水渗湿。方中附子大辛大热，为温阳诸药之首；桂枝辛甘而混，乃温通阳气耍药，二药相合，补肾阳之虚，助气化之复。然肾为水火之脏，内舍真阴真阳，阳气无阴则不化，“ 善补阳者，必于阴中求阳，则阳得阴助，而生化无穷”(《类经》卷14)，故重用干地黄滋阴补肾；配伍山茱萸、山药补肝脾而益精血。方中补阳之品药少量轻而滋阴之品药多量重，可见其立方之旨，并非峻补元阳，乃在于微微生火，鼓舞肾忾，即取“少火生气”之义。正如柯琴所云:“此肾气丸纳桂、附于滋阴剂中十倍之一，意不在补火，而在微微生火，即生肾气也”(求自《医宗金鉴·删补名医方论》卷27)。再以泽泻、茯苓利水渗湿，配桂枝又善温化痰饮；丹皮苦辛而寒，擅入血分，伍桂枝则并调血分之滞。诸药合用，助阳之弱以化水，滋阴之虚以生气，使肾阳振奋，气化复常，则诸证自除。由于本方功用主要在于温补肾气，且作丸内服，故名之“肾气丸”。
[类方比较]本方与六味地黄丸中均有地黄、山茱萸、山药、泽泻、丹皮、茯苓六药，均为补肾的常用方。其中六味地黄丸之地黄乃熟地黄，为滋补肾阴的代表方，适宜于肾阴不足之证；本方之地黄为干地黄(即生地黄)，又配伍了桂枝、附子二味温阳补火之品，故成阴中求阳，少火生气之剂，适宜于肾中阳气不足之证，亦可用治肾阴阳两虚之证。
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4疾病谱
《金匮要略》中就肾气丸所治的疾病专门谈到这几种：
1、消渴，尤其是男子消渴，多饮多尿，相当于现在所讲的糖尿病，尿崩证也属于消渴。消渴的提出，提示我们在糖尿病的治疗中也可以使用金匮肾气丸，同时也提示适用金匮肾气丸的人可能会有口渴。
2、可能用在短气，\'夫短气有微饮，当从小便去之，苓桂术甘汤主之，肾气丸亦主之\'，短气可以看作肺系疾病，也包括一些心血管疾病，病人咳喘，动则气喘，就是胸闷气短的表现，现在可以用来治疗肺气肿、支气管哮喘，包括一些心脏病。
3、可以用来治疗转胞，就是尿潴留、排便不畅。
4、还有就是脚气。脚气这个病不是我们所讲的香港脚、脚癣，是维生素B1缺乏症，在隋唐时多见，当时可能是常见病、多发病，临床表现一是可以导致下肢无力发麻，由于B1缺乏，导致下肢神经炎症，出现无力同时还可以出现浮肿，甚至影响到心脏，所以常见到下肢浮肿到全身，甚至心包、胸腔、腹腔里都有积液。
虽然在或然证中，张仲景只是提到了消渴、短气、转胞及脚气等，临床上看肾气丸主治的病种还是非常多的，主治疾病谱还是非常广的。
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肾气丸的主治疾病谱

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