微生态制剂常与胃肠粘膜保护剂联合使用，效果更理想，其能调节肠道菌群，纠正菌群失调。常用的药物有妈咪爱（枯草菌二联活菌颗粒）、培菲康、金双歧（双歧杆菌三联活菌胶囊）、常乐康（酪酸梭菌二联活菌胶囊）、整肠生（地衣芽孢杆菌胶囊）、复方嗜酸乳杆菌片及布拉氏菌胶囊等。需要注意活菌制剂时与抗菌药同服可减弱其疗效，应间隔2小时以上。不能服用胶囊的幼儿，可取胶囊内容物粉末或研碎药片后用凉开水、果汁或牛奶送服。

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