学术经纬|药效因人而异,谁在捣鬼?揭秘肠道菌群影响数十种药物活性和毒性


▎药明康德内容团队编辑顶尖学术期刊《细胞》上 , 最近刊登了一项来自美国普林斯顿大学的研究 。 论文中 , 科学家们评估了数百种常用药物 , 发现不同人的肠道菌群会对吃下去的药物造成不同的影响 , 有时会改变药物的活性 , 甚至使之产生毒性 。 这一结果为我们解释了为什么服用同样的药物 , 不同患者之间常会有“个体差异” 。
目前 , 研究人员开发了一种系统方法来评估肠道菌群对药物的影响 , 希望能切实帮助开发疗效更好、不良反应更少的个体化药物 。

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研究作者在论文中解释说 , 大多数药物是口服的 , 然后在小肠或大肠被吸收 , 进入循环系统 。 近年来 , 有一些研究表明 , 单个肠道菌种会代谢某些口服药物 。
不过 , 人类的肠道是数百种细菌的家园 。 每个人的肠道菌群由哪些种类的细菌组成 , 不同细菌占的比例各有多少 , 人与人之间有很大的差别 。 因此 , “光是研究某一种细菌 , 还无法比较个体之间肠道菌群对药物的代谢有什么不同 。 ”负责这项研究的Mohamed Donia教授说道 , “我们需要从整个肠道菌群的角度进行研究 。 ”为此 , 研究小组决定开发一套系统方案 , 结合微生物菌群培养、小分子结构分析、定量代谢组学等方法 , 分四步评估人类肠道菌群代谢口服药物的能力 。

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▲本研究示意图(图片来源:参考资料[1])
作为第一步 , 研究人员从志愿者那里收集了21份粪便样本 。 对细菌种类进行分类的结果显示 , 每个志愿者的肠道内都有一套独特的菌群 。 研究人员利用他们开发的培养系统 , 让这些个体化菌群大部分成功地在实验室中生长起来 。
随后 , 利用培养的菌群 , 研究人员测试了575种已获FDA批准上市的药物 , 查看哪些药物在经菌群代谢后 , 会有化学修饰的改变 。

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鉴定结果让他们发现了57个被肠道菌群改变的例子 。 这些改变包括将药物转变为不活跃的状态 , 意味着可能降低药物功效;有的则将药物分子转化为有毒的形式 , 意味着可能引起不良反应 。 其中有一些经过菌群代谢的产物与已知的药物不良反应有关 , 还有一些微生物代谢产物则是首次发现 。
从分析结果还可以看出 , 对于特定药物 , 来自有些志愿者的菌群产生的影响不大 , 来自另一些人的菌群却有显著影响 。 这表明 , 细菌群落而不仅仅是单一细菌物种 , 对药物代谢十分重要 。

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证明了这一点后 , 研究人员没有停步 , 以几种化疗药物为例 , 进一步挖掘药物分子是怎么被肠道菌群改变的 。 为此 , 他们追踪了特定的细菌种类 , 以及这些细菌中带来化学转变的特定基因 , 比如表达某些酶的基因 。 而利用这种方法发现的肠道菌群衍生的代谢反应 , 最终在小鼠模型中得到了重现 。 这也为将来在药物开发中评估肠道菌群的影响打下基础 。
这项研究的共同第一作者Jaime Lopez说 , “菌群中的细菌相互帮助 , 相互影响各自的酶特性 。 如果不在菌群中研究这个问题 , 就永远捕捉不到这一点 。 ”

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研究人员希望通过这套系统方法 , 带来更好的药物开发和个体化治疗方案 。 例如 , 可以在药物开发的早期阶段帮助识别潜在的药物-微生物组相互作用 , 从而改变药物的制剂;也可以在临床试验中更好地分析药物的活性和毒性;临床用药时 , 针对不同患者的肠道菌群开发个体化治疗的用药方案 , 在预测到不良反应时建议改变治疗策略等 。
随着我们对肠道菌群的了解越来越深 , 未来或许医生能为每个患者因“菌”而异提供更好的疗法 。
参考资料
[1] Bahar javdan et al., (2020) Personalized Mapping of Drug Metabolism by the Human Gut Microbiome. Cell. DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.001[2] Study investigates potential for gut microbiome to alter drug safety and efficacy. Retrieved June 15, 2020, from https://www.princeton.edu/news/2020/06/10/study-investigates-potential-gut-microbiome-alter-drug-safety-and-efficacy
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