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京都也是有日本皇宫的，而且也是归属宫内厅管理
而且，日本的这次“迁都”更有意思地是：没把话说清楚，京都的地位没有被废除，这本来是当时为了减少反对派阻力而进行的权宜之计，但是在程序上就变成了：天皇陛下只是去江户出差而已，江户改叫东京，成了陪都，但首都还是京都，一直到现在，还有京都人仍然是这么认为的。
这不仅是民间的无聊争论，就连学界都争吵不休，对于一个现代化的国家，制度和程序的规范性是很重要的，因为当时规定不明，所以日本和中国不一样，中国人一般直接说“迁都东京”了事，但在日本，这事件称为“東京奠都”（把东京定为日本首都），“奠都”和“迁都”是不一样的，一个是“奠定一个新首都，旧都城没废除”，另一个是“首都搬走”；所以关西认为天皇移驻东京只不过是为了施政的方便，京都还是名义上的首都，东京只是行政首都。关东则认为天皇和政府机关都在东京，东京是理所当然的首都。
不过，一个显而易见的事实上，东京（江户）当日本的政治中心的时间长达400余年，绝不是从明治维新才开始的。

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