华佗还没有回家，他的两个孩子在门口玩耍，迎面看见他们，小孩相互告诉说：“像是遇见咱们的父亲了，车边挂着的‘病’就是证明啦 。”病人上前进屋坐下，看到华佗屋里北面墙上悬挂这这类寄生虫的标本大约有十几条 。
有一名郡守得病，华佗认为这人极其愤怒就好了，于是多次接受他的礼品而不加以医治；没有多久弃他而去，留下书信辱骂他 。郡守果然大怒，命人追赶捕杀华佗 。郡守的儿子知道情况，嘱咐使者不要追赶 。郡守大怒得更厉害了，吐黑血数升而痊愈 。
又有一士大夫不舒服，华佗说：“您病得严重，应当开腹取疾 。然而您的寿命也不过十年，病不能使您死，忍病十年，寿命也就全到尽头，不值得自己特意开刀 。”士大夫不能忍受疼痛，发痒，一定要去除它 。华佗随即下手，所病不久痊愈，十年后终于死了 。
广陵郡太守陈登得了病，心中烦躁郁闷，脸色发红，不想吃饭 。华佗为他切脉说：“您胃中有虫好几升，将在腹内形成内一种肿胀坚硬的毒疮，是吃生鱼、生肉造成的 。”
马上做了二升药汤，先喝一升，一会儿把药全部喝了，过了一顿饭的功夫，吐出了约摸三升小虫，小虫赤红色的头都会动，一半身体还是生鱼脍的模样（脍：切得很细的鱼肉），所受病痛也就好了 。华佗说：“这种病三年后该会复发，碰到良医才以救活 。”
按照预计的时间果然旧病发作，当时华佗不在，正如华佗预言的那样，陈登终于死了 。曹操听说而召唤华佗，华佗常守在他身边 。曹操为头痛病所苦，每当发作，就心情烦乱，眼睛眩晕 。华佗只要针刺膈俞穴，应手而愈 。
李将军的妻子病得很严重，召唤华佗切脉，说：“胎儿收到伤害而不能去除 。”将军说：“听说确实胎儿受到伤害，胎儿已经去除了 。”华佗说：“切脉，胎儿没有去除啊 。”将军以为不是这样 。华佗告辞离去，妇人稍微好些，百余日后又发病，再召唤华佗 。
华佗说：“此脉相（按照）先例有胎儿 。先前应该生两个婴儿，一个婴儿先去除，血出得太多，后面的婴儿没有及时产下 。母亲自己没感觉到，旁边的人也没有领悟 。不再接生，于是不得生产 。胎儿死了，血脉不能回复，必然干燥附着他母亲的脊背，因此造成许多脊背疼痛 。
如今应当施以汤药，并针刺一处，这个死胎必定产下 。”汤药针刺施加后，妇人疼痛急着想要生产 。华佗说：“这个死胎日久干枯，不能自己出来，适宜派人掏取它 。”果然得到一个死去的男婴，手足完备，颜色发黑，长大约达到一尺 。
华佗的卓绝医技，大都像这些（指上文所述各病例） 。然而他本是读书人，以医术养活自己（见：魏晋六朝时用于动词前，有指代自己[第一人称]的作用），心里常感懊悔（按，中国封建社会中医生属于“方技”，被视为“贱业”，所以华佗时常“自悔”） 。
后来曹操亲自处理国事，所得的病十分严重（笃：十分），让华佗专为他个人治病 。华佗说：“这病近于难以治好，不断地进行治疗，可以延长一些寿命 。”华佗长期远离家乡，想回去看看，因此说：“（要治疗这个病）一定要拿到家里面的方书，所以想回家一趟 。”
到家后，推托妻子有病，多次请求延长假期不回来 。曹操多次用书信召唤，又下诏令郡县征发遣送 。华佗自恃有才能，厌恶吃侍候人的饭，还是不上路 。曹操很生气，派人前往查看：如果他妻子确实生病，就赐赠四十斛小豆，放宽假期；如果他虚假欺骗，就逮捕押送他回来 。
于是递解交付许昌监狱，拷问服罪 。荀彧向曹操求情说：“华佗的医术确实高明，关系着人的生命，应该包涵宽容他 。”曹操说：“不用担忧，天下会没有这种无能鼠辈吗？”终于拷问致死华佗 。华佗临死前，拿出一卷医书给狱官，说：“这书可以用来救活人 。”
狱吏害怕触犯法律不敢接受，华佗也不勉强，讨取火来把书烧掉了 。华佗死了以后，曹操脑神经痛没有去除 。曹操说：“华佗能治好这种病 。这小子有意拖延我的病，不加根治，想借此来抬高自己的地位，如果我不杀掉这小子，也终究不会替我断掉这病根的 。”
直到后来他的爱子仓舒（曹冲的字）病危，曹操才感叹地说：“我后悔杀了华佗，使这个儿子活活地死去了 。”
当初，军中小吏李成苦于咳嗽，早晚不能入睡，经常吐带脓的血，因此询问华佗 。华佗说：“您的病是肠道痈疽浓肿，咳嗽所吐出来的，并非从肺里来 。给您药末两钱，应当吐出二升余浓血，终了，能自己保养，一月可以小起，好好自己把握珍爱，一年便能健康 。