Nature Methods:刊发全新的circRNA的下调方法( 二 )
虽然CRISPR-Cas13已经被用于敲低RNA , 但是其在circRNA领域的应用之前还没有被开发 。 本文通过大量的实验证明了CRISPR-Cas13用于circRNA敲低的特异性 , 基本不影响亲本mRNA的表达 , 通过点突变实验也证明了gRNA种子区严格互补对于circRNA有效敲低的重要性 , 这也表明了CRISPR-Cas13更低的脱靶的可能性 。 这项研究为我们后续研究circRNA的功能提供了一个重要的工具 。
思考
本文结果显示RfxCas13d拥有更高的circRNA敲低效率 , 其结果和Konermann在18年发表在Cell上的研究结果一致 。 因此 , 我们猜测RfxCas13d将来可能会成为RNA调控领域最重要的蛋白 。 并且 , 在Konermann的文章中 , RfxCas13d融合NLS(CasRx , 融合核定位序列的RfxCas13d)之后能够很好的定位在细胞核中 , 且能够有效敲低定位于细胞核内的LncRNA 。 我们有理由相信 , 通过NLS融合的RfxCas13d , 可以有效敲低一些核定位的circRNA , 而不必利用CRISPR-Cas9或者ASO 。 进一步地 , 考虑到RfxCas13d的更小分子量(~912aa) , 可以比较容易地包装进AAV病毒 , 将其应用到体内进行敲低实验也具有非常高的可行性 。
需要注意的是 , RNA靶向的Cas蛋白都被报道或多或少拥有部分反式切割的活性 , 因此其安全性和对细胞整体水平RNA的影响仍需要进一步评估 。
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