文章中的锦上添花的招数,你会了吗?
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翻看文献,我们常常会发现,在某些比较可以的文章后面都会有一项操作,乍一看这个操作不仅漂亮而且显得很高级,像这样:
在写SCI论文,尤其是涉及到蛋白质的文章,加一个这样的操作不仅能丰富论文,也能更进一步分析蛋白的可能结合位点、区域不同导致的差异。所以,这项操作是什么呢?今天我们就来几招搞定蛋白质的二级结构预测。
1.
首先进入蛋白结构在线预测网站Predict Protein server(https:www.predictprotein.org ),网页界面清晰简洁。
2.
我们根据提示将蛋白质序列输入方框中,序列可以用TXT格式打开复制到框中即可。输入完成点击“PredictProtein”,等待预测结果。
3.
稍等片刻,预测结果页面出现,点击,查看结果。
4.
分析结果。根据出来的预测结果图,进行分析。
比如上图:该蛋白区共编码37个氨基酸,Predict Protein server预测结果显示该氨基酸组成比例最高的是亮氨酸(L)和赖氨酸(K),根据预测图我们还可以发现点击图中的小图标,得到相应的信息。比如下图:
该蛋白编码区可能的蛋白结合位点有8个,多聚核苷酸结合位点有17个,解螺旋有5个。另外跨膜螺旋和二硫键结合部位区域也可明确。
除此之外还可以通过比较两个不同组别的蛋白二级结构,要知道结构可是能够决定功能,得到相关有效信息,就如文章开头的图,可根据自己的关注点分析。
这个蛋白质二级结构在线预测的网站相比于RNA STRUCTURE等预测软件好用,并且操作巨简单,还不快来试试。
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