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编者按：
微生物组及它与我们人体健康甚至行为的关系的研究吸引了公众的注意力 ， 并且推动了益生菌及相关疗法的商业化 。 然而 ， 这一领域发展的如此之快 ， 以至于有可能已经超出了目前所存在的证据——越来越多的人开始怀疑肠道菌群研究的真实性 。
面对质疑 ， 微生物组的研究究竟应该如何发展？未来 ， 我们应该怎样更深入地研究微生物组与宿主之间的相互关系？
今天 ， 我们特别编译了近期发表在 Current Biology 杂志上题为“Gut Check”的文章 。 希望微生物组领域的相关研究人员和产业人士能够停下脚步 ， 共同思考未来的微生物组研究应该如何发展 。
① 质疑声不断
21 世纪伊始 ， 医学界出现了一系列引人注目的进步 ， 包括能够操纵基因组的 CRISPR 技术 ， 以及利用免疫系统寻找和消灭癌症的技术 。当然 ， 在医学热门趋势的候选名单中 ， 人们越来越意识到 ， 我们的身体正与数十亿种微生物亲密接触 ， 而这些微生物是我们健康和幸福所依赖的 。 如果我们相信其中一些说法 ， 那么就表示你相信这些微生物不仅为我们提供了食物 ， 而且可能是其它许多身体功能所必需的 ， 甚至令人震惊的是——它们可能为了自身的利益而操纵我们的行为 。
大多数研究的注意力都集中在肠道内的微生物群落——所谓的“肠道菌群” 。 但机体中还存在其它菌群 ， 包括皮肤菌群、阴道菌群等等 。
就肠道菌群而言 ， 我们现在所谈论的并非那小部分“偷渡客” 。 一些研究估计肠道微生物的数量等于或超过人体细胞的数量 。 这也许解释了该领域的吸引力——微生物组可以被视为我们身体的一个重要组成部分 ， 我们以前对此视而不见 ， 就好像我们一辈子都感受不到自己有肝脏一样 。 事实上 ， 肠道菌群也被比作某种器官 。
观察肠道菌群的另一种角度是将其视为一个复杂的生态系统 ， 例如热带雨林 ， 其中许多组分相互依赖 ， 最微小的干扰就会破坏微妙的平衡 ， 从而可能导致疾病 。
这是一个贯穿于围绕肠道菌群的讨论的主题 ， 不仅被研究人员所关注 ， 而且也被那些希望利用肠道菌群获得经济利益的人所关注 。
例如 ， 有人告诉我们 ， 我们的抑郁和焦虑可以用“紊乱”的菌群来解释 ， 或者用一种奇特的医学术语来说 ， 我们正在经历“菌群失调” 。 在益生菌行业 ， 或许会有人承诺说 ， 可以用一片药片来恢复我们的肠道健康 ， 并将以某种方式来使我们回归正轨 。
与很多新研究领域一样 ， 最初的兴奋已经超越了已有的证据 ， 肠道微生物领域也经历了起伏 。 人们对操纵肠道微生物来治疗疾病的前景产生了强烈的兴趣 ， 但由于早期尤其是在益生菌方面的医学主张未能成功 ， 人们对此深表怀疑 。 不仅如此 ， 基础研究方面也未能幸免于怀疑 ， 尤其是关于肠道微生物可能操纵大脑和我们的行为以获取自身利益的说法 。
此外 ， 该领域还被指责坚持认为微生物组本身是疾病的潜在病因 ， 而不是采用还原论的方法来识别可能引起疾病或避免疾病的特定微生物或微生物群 。 尽管初期步履蹒跚 ， 但该领域似乎已经接受了这些批评 ， 并且正在以富有成效的方式向前发展 。
（编者注：还原论是一种哲学思想 ， 认为复杂的系统、事务、现象可以通过将其化解、拆解各部分的方法来加以理解和描述 ， 例如解剖学 。 ）
虽然像益生菌等治疗方法最初的期望在很大程度上并未实现 ， 但新的研究表明这种方法仍具有优点 。 这些最新的发展也带来了各种各样的问题 ， 包括肠道微生物组到底是什么 ， 它存在的理由是什么 ， 以及我们如何利用这些信息来改善我们的生活 。
② 肠道菌群作为生物反应器
稿源：(热心肠先生)
【】网址：http://www.shadafang.com/c/hn1105c5Z02020.html
标题：质疑|Cell子刊：面对质疑，微生物组研究未来该如何发展？
