陈根:从潜力无限到时候未到,AI制药可堪大用?

【陈根:从潜力无限到时候未到,AI制药可堪大用?】文/陈根
人工智能(AI)发展至今 , 已成为社会生活和生产中一种非常真实的力量 。 这种力量将会 , 甚至已经 , 颠覆了世界上的几乎所有行为 。 随着机器人、智能手表、智能音箱、虚拟助理等科技产品的出现 , 人工智能技术的迅猛发展及其在医疗卫生领域的深度应用 , 将极大改变原有社会的面貌 。
目前 , 人工智能在医疗卫生领域广泛应用正形成全球共识 。 可以说 , 人工智能以独特的方式捍卫着人类健康福祉 。 除了在诊疗手术、就医管理、医疗保险领域发挥作用 , 基于算法的人工智能近年来更是推动着疾病与药物研究的革新 , 并越来越体现其优势 。
制药业作为一个古老悠久又对人类至关重要的行业 , 人工智能何以成为制药业未来趋势?在人工智能制药全面到来之前 , 制药业还将面临什么挑战?
陈根:从潜力无限到时候未到,AI制药可堪大用?文章插图
AI制药 , 潜力无限
制药业是危险与迷人并存的行业 。 通常 , 一款药物的研发可以分为药物发现和临床研究两个阶段 。
在药物发现阶段 , 需要科学家先建立疾病假说 , 发现靶点 , 设计化合物 , 再是展开临床前研究 。 而传统药企在药物研发过程中则必须进行大量模拟测试 , 研发周期长、成本高、成功率低 。 根据《自然》数据 , 一款新药的研发成本大约是26亿美元 , 耗时约10年 , 而成功率则不到十分之一 。
其中 , 仅发现靶点、设计化合物环节 , 就障碍重重 , 包括苗头化合物筛选、先导化合物优化、候选化合物的确定、合成等 , 每一步都面临较高的淘汰率 。
对于发现靶点来说 , 需要通过不断的实验筛选 , 从几百个分子中寻找有治疗效果的化学分子 。 此外 , 人类思维有一定趋同性 , 针对同一个靶点的新药 , 有时难免结构相近、甚至引发专利诉讼 。 最后 , 一种药物 , 可能需要对成千上万种化合物进行筛选 。 即便这样 , 也仅有几种能顺利进入最后的研发环节 。
然而 , 通过人工智能技术却可以寻找疾病、基因和药物之间的深层次联系 , 以降低高昂的研发费用和失败率 。 基于疾病代谢数据、大规模基因组识别、蛋白组学、代谢组学 , AI可以对候选化合物进行虚拟高通量筛选 , 寻找药物与疾病、疾病与基因的链接关系 , 提升药物开发效率 , 提高药物开发的成功率 。
具体而言 , 科研人员可以使用人工智能的文本分析功能搜索并剖析海量文献、专利和临床结果 , 找出潜在的、被忽视的通路、蛋白、机制等与疾病的相关关系 , 进一步提出新的可供测试的假说 , 从而找到新机制和新靶点 。 渐冻人症(ALS)就是由特定基因引起的一类罕见病 , 而IBM Watson使用人工智能技术来检测数万个基因与ALS的关联性 , 成功发现了5个与ALS相关的基因 , 推进了人类对渐冻人症的研究进展(此前医学已发现了3个与ALS相关基因) 。
在候选化合物方面 , 人工智能可以进行虚拟筛选 , 帮助科研人员高效找到活性较高的化合物 , 提高潜在药物的筛选速度和成功率 。 比如 , 美国Atomwise公司使用深度卷积神经网络AtomNet来支持基于结构的药物设计辅助药品研发 , 通过AI分析药物数据库模拟研发过程 , 预测潜在的候选药物 , 评估新药研发风险 , 预测药物效果 。 制药公司Astellas与NuMedii公司合作使用基于神经网络的算法寻找新的候选药物、预测疾病的生物标志物 。
当药物研发经历药物发现阶段 , 成功进入临床研究阶段时 , 则进入了整个药物批准程序中最耗时且成本最高的阶段 。 临床试验分为多阶段进行 , 包括临床I期(安全性) , 临床II期(有效性) , 和临床III期(大规模的安全性和有效性)的测试 。
传统的临床试验中 , 招募患者成本很高 , 信息不对称是需要解决的首要问题 。 CB Insights的一项调查显示 , 临床试验延后的最大原因来自人员招募环节 , 约有80%的试验无法按时找到理想的试药志愿者 。
临床试验中的一大重要部分 , 在于严格遵守协议 。 简言之 , 如果志愿者未能遵守试验规则 , 那么必须将相关数据从集合当中删除 。 否则 , 一旦未能及时发现 , 这些包含错误用药背景的数据可能严重歪曲试验结果 。 此外 , 保证参与者在正确时间服用正确的药物 , 对于维护结果的准确性也同样重要 。
但这些难点却可以在人工智能技术下被解决 。 比如 , 人工智能可以利用技术手段从患者医疗记录中提取有效信息 , 并与正在进行的临床研究进行匹配 , 从而很大程度上简化了招募过程 。