最后双方就在和通泊湖展开了决战，大部分清军战死，只有傅尔丹领着2000多人逃回了科布多城。
“博克托岭、和通泊之战”清军被俘和阵亡7000多人，仅京师八旗就阵亡4583人，阵亡的高级将领中甚至有两个公爵，分别是郑亲王济尔哈朗之孙辅国公爱新觉罗·巴赛和鳌拜的孙子一等超武公达福。
此战的失败迫使雍正与准噶尔汗国议和，双方约定以阿尔泰山为界，直到乾隆二十二年清廷才彻底消灭准噶尔汗国。

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