科研风暴人类细胞图谱（HCA）计划：大型、权威的单细胞测序数据来源( 二 )

本文插图
网站还有五个元数据字典部分（生物材料，过程，协议，项目，文件），用来列出用于描述人类细胞图集中数据集的当前元数据字段集。每个部分中的元数据字段表示实验的不同部分生物材料（例如组织样本）可以经过处理（例如解离）以产生另一种生物材料（例如离解的细胞样本）或一组数据文件（fastq文件）。实际执行的过程遵循特定协议这些部分构成了整个项目（例如，了解人类心脏中的细胞类型）。

本文插图
使用HCA元数据实体模型建模的单细胞测序实验示例
这个数据库比较简单，也不像其他数据库有很多图片展示，以上就是本期关于HCA的内容了，需要的伙伴可以动手探索一下。
人类细胞图谱（HCA）计划最近相关论文发表：KedarNath Natarajan, Zhichao Miao, Miaomiao Jiang, et al. Comparative analysis ofsequencing technologies for single-cell transcriptomics. Genome Biol. 2019 Apr9;20(1):70.YuyuNiu, Nianqin Sun, Chang Li, et al. Dissecting primate early post-implantationdevelopment using long-term in vitro embryo culture. Science. 2019 Nov15;366(6467): eaaw5754.Linnan Zhu, Penghui Yang, Yingze Zhao et al.Distinct immune response landscapes of COVID-19 and influenza patients revealedby single-cell sequencing. Immunity, 2020 (In press).Han, L., Wei, X., Liu, C., Volpe, G., Wang,Z., Pan, T., … Liu, L. (2020). Single-cell atlas of a non-human primate revealsnew pathogenic mechanisms of COVID-19. BioRxiv, 2020. https://doi.org/10.1101/2020.04.10.022103Lei, Y., Cheng, M., Li, Z., Zhuang, Z., Wu,L., Han, L., … Liu, S. (2020). Single-cell regulatory landscape and diseasevulnerability map of adult Macaque cortex. BioRxiv, 2020.https://doi.org/10.1101/2020.05