人类基因组草图再添细节 开启基因组学研究新纪元( 二 )
Y染色体为男性特有 , 只能来自于父亲的遗传 , 有点类似古人说的‘一脉相承’ 。 汪强虎告诉采访人员 , 就是爷爷传给父亲 , 父亲传给儿子 。 因此 , 一个家族里只要对一位男性的Y染色体进行了检测 , 也就基本知道这个家族里其他男性的Y染色体什么样 。
女性会继承两条X染色体 , 一条来自母亲 , 一条来自父亲 。 但是 , 这两条X染色体并不相同 , 它们的DNA序列包含许多差异 。
在这项研究中 , 研究人员没有对人类正常细胞的X染色体进行测序 。 而是选用了一种特殊的雌性细胞——具有两条来源相同的X染色体 。 与仅具有X染色体单拷贝的雄性细胞相比 , 这种细胞可提供更多的DNA进行测序 。 它还可以避免分析典型雌性细胞的两个X染色体时遇到的序列差异 。
纳米孔技术是X染色体测序最大功臣
与20年前获得的人类基因组草图相比 , 这次科学家将X染色体完整测序 , 最大功臣就是纳米孔测序技术 。
这是一种第三代测序技术 。 据汪强虎介绍 , 1996年美国哈佛大学的丹尼尔·布兰顿、加州大学的大卫·迪默及其同事 , 在美国《国家科学院院刊》杂志上首次发表文章指出 , 可以用膜通道检测多核酸序列 , 成为纳米孔测序技术的起源 。
此次研究使用的是一种特殊的纳米孔测序仪 , 它通过检测单个DNA分子通过膜上的小孔(纳米孔)时电流的变化 , 对DNA进行测序 。
纳米孔测序技术可以获得包含数十万个碱基对的‘超长读取’ , 这样的长度可以跨越整个重复区域 , 从而绕过了一些复杂的挑战 。 汪强虎告诉采访人员 , 第一代基因测序技术一次只能读取几百个碱基对 , 近二十年来测序技术取得长足进步 , 让那些曾经被认为十分棘手的重复序列测序 , 变得相对容易 。
这一成果无疑是个里程碑 。 汪强虎表示 , 通过分析X染色体的基因信息 , 科学家或将很快攻克一些复杂疑难疾病 。
比如X染色体上有著名的基因F8(凝血因子8)和F9(凝血因子9) , 凝血因子8和9缺乏会导致血友病 。
因为男性只有一条X染色体 , 一旦出现问题 , 就无法正常产生凝血因子8和9 。 这也是为何血友病通常发生在男性身上的原因:女性带有两条X染色体 , 如果有一条染色体出现问题 , 而另一条正常 , 通常不会出现血友病的病症 , 但是会遗传给下一代 。
汪强虎认为 , 新的人类基因组序列填补了目前人类参考基因组中的许多缺口 , 为基因组研究开辟了新的领域 。 但潜在的挑战依然存在 , 比如 , 1号染色体和9号染色体的重复DNA片段比X染色体上的要长得多 。 科学家接下来计划继续努力弥合更多未知的缺口区域 。
与此同时 , 针对中国人的多个基因组计划也在实施之中 , 汪强虎介绍说:目前人类参考基因组是以欧美人群为蓝本 , 但是欧美人群与中国人的基因还存在细微差别 。 例如中国工程院院士、南京医科大学沈洪兵教授课题组通过全基因组关联研究 , 找到与中国人肺癌有关的19个易感基因 , 作为中国人群肺癌多基因遗传风险评估指标 , 可实现前瞻性预防 。 (采访人员 张 晔)
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