『昊明有态度』孔凡江/刘宝辉团队报道作物驯化过程中开花期基因的进化与选择分子机制作者丨小柯2020年3月30日

作者丨小柯
2020年3月30日，广州大学生命科学学院/分子遗传与进化创新研究中心的孔凡江和刘宝辉研究团队以广州大学为第一通讯单位，在NatureGenetics发表了题为“StepwiseselectiononhomeologousPRRgenescontrollingfloweringandmaturityduringsoybeandomestication”的最新研究成果。

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栽培大豆5000年前起源于我国的黄淮海区域，有着悠久的种植历史，在我国的农业生产中占据着重要的地位。
大豆是光周期极为敏感的典型短日照作物，单个品种或种质资源一般只适宜种植于纬度跨度较小的区域内，那么起源于黄淮海区域的大豆是如何适应全世界广泛的生态环境呢？又是如何影响大豆的产量和在世界范围的种植和分布呢？
为了探究该科学问题，孔凡江/刘宝辉研究团队多年以来进行了长期系统和深入的研究。
利用基因组学分析、生物信息学和经典正向遗传学相结合的方法，发掘了两个长日照条件下控制开花期的关键位点Tof11和Tof12 。
【『昊明有态度』孔凡江/刘宝辉团队报道作物驯化过程中开花期基因的进化与选择分子机制】分子机制解析表明， Tof11和Tof12通过调控LHY和E1基因控制大豆光周期开花，建立了完整的光周期调控分子网络（图1）。
研究同时发现， Tof11和Tof12发生了渐进式的变异和人工选择。
其中， tof12-1的功能缺失突变首先被强烈选择，使栽培品种的开花期和成熟期普遍提前；tof11-1的功能缺失型突变的发生于tof12-1之后，在tof12-1遗传背景上再次受到选择，从而进一步缩短了栽培大豆的开花期和生育期，因此提高了栽培大豆的适应性和种植。
该研究首次系统报道了作物驯化过程中开花期基因的进化与选择分子机制。

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图1大豆光周期开花和产量形成的分子模式图
值得一提的是， 2017年孔凡江/刘宝辉研究团队在NatureGenetics上先期报道了大豆长童期(LongJuvenile)关键基因J的克隆及进化机制研究成果“NaturalvariationatthesoybeanJlocusimprovesadaptationtothetropicsandenhancesyield” 。
研究发现， J基因多种功能缺失变异的产生使大豆在短日诱导条件下仍能保持相对较长的营养生长，获得高产，从而突破了大豆在低纬度地区产量极低的限制，使大豆在低纬度（尤其是南美地区）得以快速扩张和推广，改变了世界大豆生产格局（图2）。
两篇文章相互补充，不仅进一步完善了以E1基因为关键节点的大豆开花分子调控网络，而且系统阐释了J基因促进大豆低纬度适应， Tof11和Tof12促进大豆中高纬度适应的多基因进化机制，为大豆品种适应性和产量分子育种提供了重要的理论依据和应用基础。

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图2大豆适应热带短日照地区的模式图
广州大学分子遗传与进化创新研究中心的芦思佳副教授、董利东讲师、程群讲师、博士后方超、博士后孔令平、博士后陈丽玉和中科院遗传所的刘书林博士为文章的共同第一作者。
广州大学孔凡江教授、刘宝辉教授，澳大利亚塔斯马尼亚大学JamesWeller教授，中科院遗传发育所田志喜研究员和武汉理工大学袁晓辉教授为文章的共同通讯作者。
论文信息：
https://doi.org/10.1038/s41588-020-0604-7
https://doi.org/10.1038/ng.3819