你为什么胖?代谢产物和m6A惹的祸

原标题:你为什么胖?代谢产物和m6A惹的祸
m6A很火~
代谢组学很火~
肥胖很火~
三者在一起更火~

你为什么胖?代谢产物和m6A惹的祸
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来来来
套路学起来~
国自然热点蹭起来~
今天小编要分享的影响因子IF为12.1540的这篇研究证明了NADP通过增强FTO活性调节RNAm6A甲基化和脂肪生成 。

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背景知识
代谢对于生物学至关重要 , 代谢物可能直接调节控制可逆RNA修饰的酶(例如N6-甲基腺苷(m6A))的活性 , 从而调节RNA 。 多种代谢性疾病与脂肪和肥胖相关蛋白(FTO)(一种m6A脱甲基酶)之间的关联部分支持了这一点 。 m6A是哺乳动物中最丰富的mRNA修饰 , 并且涉及各种生物学过程 。
在看Fig前 , 我们先来重温一下m6A调控三剑客~

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多种代谢性疾病与脂肪量和肥胖相关蛋白(FTO)高度相关 。 但是 , 是否以及哪些代谢物直接调节m6A仍然难以捉摸 。
为了便于理解 , 小编依然贴心的为大家做了一个流程图~

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作者使用荧光淬灭试验筛选了一组代谢物 , 并确定了NADP与FTO显着结合 , 独立增加FTO活性 , 并促进RNAm6A去甲基化和脂肪形成 。 此外 , FTO的缺失阻断了3T3-L1前脂肪细胞中NADP增强导致的的脂肪生成 。 这些结果建立了新陈代谢与RNAm6A去甲基化之间的直接联系 , 即将代谢组学和RNA表观遗传联系起来 。
正文部分

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Fig1.MARTFQ筛选显示NADP直接结合FTO
作者使用MARTFQ筛选与FTO直接结合的代谢物 , 发现NADH、NADPH与FTO具有结合且结合能力高于Vc , 进一步估计代谢物的结合常数(K值) , 结果表明NADPH和NADH的K值高于FTO的两个已知辅助因子Fe2+和Vc(b-d) 。 DARTS和CETSA测定进一步证明了以上结果(e , f) 。 此外NADPH具有增强FTO热稳定性的重要能力(g) 。
备注:

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MARTFQ(代谢物亲和力反应靶荧光猝灭)测定方法原理:基于配体诱导的焦油内含色氨酸蛋白(如FTO)的固有荧光猝灭 , 代谢物显示出独特的能力来淬灭FTO发射的荧光 。
药物亲和力响应靶标稳定性(DARTS)分析基于配体结合后体外靶蛋白的蛋白酶敏感性降低 。
细胞热位移分析(CETSA)利用体内靶标蛋白增强配体的热稳定性 。

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Fig2.NADP增加体外FTO活性
作者将不同浓度的NADPH , NADP+ , NADH+ , NAD+或Vc分别添加到含有m6AssRNA , FTO , Fe2+和2酮戊二酸(2KG)的反应混合物中进行孵育 。 质谱分析表明 , NADPH和NADH比Vc具有更高的增强FTO活性的功能(a , b) 。 ALKBH5与FTO具有一样的功能即去甲基化 , 那么NADPH是否可以增强其活性呢?图c , d结果显示 , ALKBH5不是很依赖于辅因子且NADPH的存在较小的提升了ALKBH5的活力 。

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Fig3.细胞内NADPH通过FTO调节RNAm6A甲基化水平
为了评估了NADP/NAD改变对RNAm6A甲基化水平的影响 。 作者用NADPH , NADP+ , NADH或NAD+处理3T3-L1和HEK293细胞 , 发现所有这些辅助因子均分别降低了RNAm6A甲基化水平 , 其中NADPH最显著(a) 。 作者评估了高脂饮食(HFD)或腹膜内注射葡萄糖组的小鼠脂肪垫和肝脏中NADP和NAD的水平 , HFD或葡萄糖注射显著增加了脂肪垫和肝脏中NADP的水平(b) 。 之后作者聚焦NADP , 用NADPH或Vc处理细胞 , MS和斑点印迹分析表明 , Vc对RNAm6A甲基化水平几乎没有影响 , 而NADPH显著降低了RNAm6A甲基化水平(d) 。 作者通过增强或敲低NADP代谢的两种限速酶NAD激酶(NADK)或葡萄糖6-磷酸脱氢酶(G6PD)模拟NADP的代谢变化 。 NADK或G6PD增加使得RNAm6A甲基化降低(e , f) 。 相反 , siRNA或G6PD抑制剂(6-aminonicotinamide(6AN))处理使得RNAm6A甲基化增加(h) 。 NADPH添加可中和敲降导致的RNAm6A甲基化水平增加(i) 。 由此说明NADK或G6PD抑制是通过NADP途径增强RNAm6A甲基化水平 。 那是否是通过FTO调节细胞中的RNAm6A甲基化水平呢?作者分别进行FTO、ALKBH5、METTL3的敲低 , 结果显示FTO的敲低提高了RNAm6A甲基化水平(j) , 且FTO敲低后 , 6AN、NADPH、FB23-2(FTO抑制剂)丧失了细胞中调节RNAm6A甲基化的大部分功能(j , k) 。 这些结果表明细胞内NADP通过FTO调节RNAm6A甲基化水平 。