最终，国家药监局医疗器械司原司长郝和平犯受贿罪、非法持有枪支罪，两罪并罚，决定执行有期徒刑十五年，并处没收个人财产人民币20万元；郝和平之妻、国药集团联合医疗器械有限责任公司原行政部主任付玉清，因共同受贿，判处有期徒刑五年；

曹文庄犯受贿罪、玩忽职守罪，两罪并罚，决定执行死刑，缓期二年执行，剥夺政治权利终身，并处没收个人全部财产。

曹文庄之后，中央纪委监察部在2007年3月1日公布，国家药监局原局长郑筱萸严重违纪，给予开除党籍、行政开除处分，对其涉嫌犯罪问题移送司法机关依法处理。

北京市第一中级人民法院经公开开庭审理，认定郑筱萸犯受贿罪、玩忽职守罪，两罪并罚，决定执行死刑，剥夺政治权利终身，没收个人全部财产。郑筱萸提出上诉。经终审判决和死刑复核，2007年7月10日，郑筱萸在北京被执行死刑。

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