HIV研究迎来重要进展!《科学》揭示衣壳的重要作用

▎药明康德内容团队编辑
《科学》杂志近日发表了一篇关于HIV研究的重要论文 。 美国弗吉尼亚大学(UniversityofVirginia)和犹他大学(UniversityofUtah)的科学家们合作 , 构建了一个无细胞的体系 , 首次让HIV在体外依次完成逆转录和整合 。 通过这个无细胞的体系 , 科学家们得以更好地观察对于HIV感染而言至关重要的两个步骤 。 他们也发现病毒的衣壳(capsid)在这两个步骤中扮演的全新角色 。
HIV研究迎来重要进展!《科学》揭示衣壳的重要作用
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作为一种逆转录病毒 , HIV能将自己的病毒RNA基因组逆转录为双链的DNA , 并整合入所感染细胞的基因组内 。 过去几十年 , 科学家们通过一系列结构、生化、以及分子病毒学的分析 , 已经阐明了参与这些步骤的多个酶反应 。 但由于这些病毒颗粒深藏于细胞质与细胞核中 , 很难对其进行机制上的研究 。 这也是为何科学家们想要开发一个“无细胞”的体系 。
先前 , 也有一些体外实验可以研究逆转录 , 或是整合的步骤 , 但这些实验一次只能观察一个步骤 。 而在本研究中 , 科学家们设计和优化的体系可以连续观察这两个步骤 。
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▲连续观察HIV-1基因组逆转录和整合的体外无细胞体系(图片来源:参考资料[1])
具体来看 , 他们纯化了HIV-1病毒体 , 使用能穿孔的多肽 , 在病毒包膜上“打”了一些小洞 。 随后 , 他们添加了一些dNTPs , 促使逆转录的发生 。 实验中 , 科学家们成功观察到了双链DNA的积累 。 随后 , 科学家们往实验体系中添加了细胞提取物 , 重现了病毒DNA整合入外源DNA的过程 。 测序结果确认病毒DNA整合的方式与预期一致 。
【HIV研究迎来重要进展!《科学》揭示衣壳的重要作用】有意思的是 , 在确认哪些要素对于病毒的逆转录和整合起到关键作用的时候 , 一个意想不到的结果出现在科学家们面前——HIV的衣壳 。 从结构上看 , 衣壳是包裹在病毒遗传物质外的一层保护 。 但这篇论文发现 , 衣壳在病毒感染的过程中 , 起到了更为主动的作用 。
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▲HIV的衣壳(黄色和紫色所示)包裹着病毒的RNA(蓝色所示)(图片来源:参考资料[2];Credit:JanetIwasa)
通过遗传学或生物化学的方法 , 研究人员们发现 , 如果衣壳变得不稳定 , 病毒就无法通过逆转录来复制自己的遗传物质 。 这也是科学家们首次直接表明 , 衣壳是HIV感染的重要元件 。
俗话说眼见为实 。 为了看清衣壳如何参与到了HIV感染的过程 , 研究人员们使用冷冻电镜技术 , 看到在逆转录的过程中 , 衣壳大部分都保持完整 。 在逆转录发生的8-10个小时后 , 研究人员们依旧可以观察到大型的完整衣壳结构 , 且病毒的核酸从衣壳的网状晶格结构中排出 。 这一时间段恰好是逆转录产物积聚到峰值 , 发生整合的时间 。
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▲冷冻电镜和分子建模技术让我们有机会以前所未有的细节看清病毒(图片来源:参考资料[2];Credit:OwenPornillos,BarbieGanser-Pornillos)
“这和教科书上写的不一样 , ”本研究的通讯作者之一WesleyI.Sundquist教授说道 , “我们的数据显示病毒的衣壳在支持有效的逆转录方面 , 扮演了主动且不可或缺的角色 。 ”
研究人员们指出 , 这项研究在无细胞的体系中重塑了HIV的逆转录和整合 , 并表明病毒的衣壳在其中起到了重要的作用 。 与先前的理解不同 , 它不仅能保护病毒基因组 , 让病毒跨越细胞质 , 进入细胞核 , 接近整合位点 , 它还是逆转录过程的关键 。