蚊子|陈根：S蛋白增加病毒突变，Delta毒株渐成优势变种( 二 ) 昆虫

在这个过程中，新冠病毒会打压其他mRNA的翻译。新冠病毒蛋白Nsp1是病毒RNA进入之后最早翻译的一批蛋白之一，它会招募宿主的相关酶，切碎所有没有打上病毒标签的mRNA 。
同样在Nsp1的作用下，进入通道被阻断， mRNA无法进入核糖体内部，细胞内总蛋白质翻译将减少70% 。值得一提的是，与其他呼吸道病毒相比，新冠病毒感染诱导的干扰素水平显著降低。
在完成病毒自我复制后，病毒RNA和衣壳蛋白就将自我装配形成成熟的病毒颗粒，这个时候，新生的新冠病毒就需要离开细胞。与其他冠状病毒的S蛋白的S1和S2亚基的连接处是1个精氨酸不同，新冠病毒的连接处是一段由5个氨基酸组成的短肽。
这段短肽刚好构成另一种蛋白酶，即Furin蛋白酶的切割位点，这使得S蛋白结构变得松散，才能够快速进入细胞。而在Alpha和Delta毒株中，这条短肽进一步进化了，脯氨酸分别被替换为组氨酸和精氨酸。这两种变化都会降低序列的酸性，提高Furin蛋白酶的识别、切割效率。
也就是说，在突变毒株中，更多的S蛋白整装待发，能够感染人类细胞。对于此，德克萨斯大学加尔维斯顿分校的病毒学者Vineet Menachery表示，在SARS病毒中，修饰好的S蛋白只有约10% ，但在Alpha毒株中上升至50% ，在Delta毒株中，则超过75% 。
这样的病理机制让Delta毒株当之无愧地成为病毒优势毒株。近日，广东省疾控中心的流行病学专家追踪了COVID-19暴露后隔离的62人，这些人也是中国大陆的首批Delta毒株感染者。
团队在研究对象感染期间每天检测其“病毒载量”（viral load）——病毒载量是衡量人体内病毒颗粒密度的指标——以此观察病毒载量随时间的变化。随后，研究团队将这些人的感染模式与在2020年感染原始毒株的63人进行了对比。
结果发现， Delta毒株在暴露后4天就能被检测到，而原始毒株在暴露后被检测到的平均时间是6天，这说明Delta毒株的复制速度要快很多。 Delta毒株感染者的病毒载量也比原始毒株感染者最多高了1260倍。
与疫情的时间赛跑
可以看见， Delta毒株传播力强、潜伏期短、病毒载量高。晚一天发现，阳性病例就指数增长；晚一周发现，代价惨重就非常被动。这也是此次南京疫情最终造成蔓延的原因所在。
与广州、深圳、瑞丽的Delta毒株疫情不同，南京发现得偏晚，谈不上及时采取有力管控，导致疫情蔓延到本省宿迁市和其他4省7市（广东中山、珠海，四川绵阳，辽宁沈阳、大连，安徽芜湖、马鞍山），相关感染者共13例。
南京正在进行第二轮全员核酸检测，紧接着进行第三轮，必然报告更多的阳性病例。南京“七普”人口931.5万，进行三轮全员核酸检测耗费了巨大的人力、财力、物力，为了保护市民的健康和全国的安宁，不得不两害相权取其轻。
与阳性病例迅速增加同步，南京的中高风险地区也迅速增加。截至7月27日15时，全国高风险地区5个、中风险地区41个；其中南京市高风险地区4个、中风险地区36个；另有中风险地区3个（辽宁省沈阳市大东区、四川省绵阳市涪城区、江苏省宿迁市泗阳县）与南京此轮疫情关联。
已确诊的病例中除了大量机场工作人员，还有高校宿管人员、培训老师、出租司机等易引发疫情传播的高危行业人员被感染。疫情在南京和全国是否进一步扩散，至少要观察两个潜伏期，并在南京第三轮核酸检测结果出来后再判断。
【蚊子|陈根：S蛋白增加病毒突变，Delta毒株渐成优势变种】与世界各国不同，我国各地、各级对新冠疫情至今“零容忍” ，人们也习惯了“动态清零” ，这使得国家卫健委不妨牵头调研总结广州、深圳、瑞丽、南京的正反两方面防控经验，统一制定科学、规范的Delta毒株全国防疫指南。
Delta变异毒株威力不容小觑。从阿尔法（Alpha B.1.1.7 ）到德尔塔（Delta B.1.617.2），新冠的变异毒株正在颠覆人类的防控。不难发现，这四株对人类影响较大的新冠病毒变异毒株，每一株变异的时间均发生在疫情爆发期，疫情越严重，病毒变异的机会越增加。建立抗疫建立新防线刻不容缓。
当前，许多关于Delta毒株的问题依然未明，比如目前仍不清楚Delta毒株是否比原始毒株更易导致重症，以及Delta毒株逃逸免疫系统的能力到底有多强。显然，进入疫苗阶段后，病毒在变化，变异不断出现，防控策略也应该随着变化。