「华大基因」ICL,吹哨的抗疫特种部队


作者:独立医学实验室资讯
独立医学实验室(Independent Clinical Laboratory,简称ICL)是指在卫生部门许可下 , 具有独立法人资格 , 独立于医疗机构之外 , 能独立承担相关的医疗责任 , 专业从事医学检验和病理诊断服务的医疗机构 , 又称第三方医学检验实验室 。
截至2019年年末 , 有统计显示我国共有独立医学实验室1538家 , 本文主要依据公开资料 , 对独立医学实验室在本次重大疫情防控过程中 , 从最初的发现病毒到帮助基层强化检测实力 , 所发挥的巨大作用进行梳理和呈现 。
ICL , 真正的疫情吹哨角色
本次疫情发生后 , ICL行业高效响应武汉有关医院的委托 , 最早从有关病患者的标本中检测出新型冠状病毒 , 并及时向国家权威研究机构分享数据 , 同时向属地卫健委上报相关检测报告 , 履行了预警的职责 , 扮演了吹哨的角色 。
微远 , 最早发现新型冠状病毒 。 12月24日 , 广州微远基因科技有限公司(简称微远)接受武汉中心医院委托 , 为一名华南海鲜市场的65岁男性送货员(6天前发热经使用各种抗生素治疗无效) , 从气管镜采样的肺泡灌洗液样本进行NGS检测 。
2天后 , 微远基因发现样本报出敏感病原体——SARS冠状病毒 , 顿感事关重大 , 立即将数据分享给中国医学科学院病原所;1月27日 , 微远组装出了接近完整的病毒基因组序列 , 基本确认该患者的样本里有一个跟Bat SARS like coronavirus(蝙蝠类SARS冠状病毒)类似的新型病毒 , 数据同时共享给中国医学科学院病原所 。
12月26日 , 华大接受武汉协和医院的样本进行NGS检测;3天后 , 华大基因对协和病例样本完成基因测序 , 结果显示 , 病毒与SARS基因序列相似性高达80% , 但不是SARS , 而是一种之前未有的冠状病毒 。
12月31日 , 华大基因将收集到的三例类SARS的冠状病毒混装 , 即将三个病毒基因序列片段合在一起形成了一个混装的全基因序列 。 同日 , 国家卫健委专家组上午已抵达武汉 , 正展开相关检测核实工作 。 1月1日 , 华大基因这份混装的新型冠状病毒基因序列提供给了中国疾控中心 , 三份检测报告也上报武汉市卫健委 。 同日 , 华大基因重新做了整个基因组 , 当天拿到了一个全基因组序列 。 1月3日 , 华大基因对三份样本中的病毒都完成了全基因序列测序 。
12月27日 , 北京博奥医学检验所有限公司接受武汉市中心医院的委托 , 为一名家住武昌 , 从未去过汉口华南海鲜市场的41岁陈姓男子 , 从支气管镜取样的样本进行了NGS检测;3天后 , 博奥将病人的送检报告反馈给了医生 , 检测报告显示是“SARS coronavirus”(SARS冠状病毒) 。
“他们的基因库不够全 , 也可能是没做复核 , 所以犯了一个小错误 , 实际上跟SARS不是一回事 , 就是一种新型冠状病毒 。 ”一位基因测序专家向相关采访人员透露 。 然而 , 就是这份犯了一个小错误的检测报告 , 却直接引起了武汉医生们的注意 , 通过社交媒体吹响了对公众的警哨 , 在一定程度上挽救了相当多人的生命 。
ICL , 抗疫战场上的特种兵
武汉是全国医疗资源较为集中的城市之一 。 统计数据显示 , 在国内大型城市中 , 武汉拥有三甲医院的数量(45个)在全国排名第三 , 每万人三甲医院数(0.04131)排名全国第一;千人床位数(8.409)位列第四;千人卫生技术人员数(11.696)位列第二 , 仅次于北京(12.761) 。
截至目前 , 金域医学、迪安诊断、艾迪康、达安、华大基因等行业领先的独立医学实验室都已布局武汉 , 在武汉设有分支机构 。
武汉2019年12月发生新冠肺炎疫情以来 , ICL行业发挥其独特的优势 , 不仅参与了新型冠状病毒的早期发现 , 湖北14家独立医学实验室和18家疾病预防控制中心、66家医院的检验科共同承担新冠病毒核酸检测 。 其中 , 独立医学实验室经过提速 , 2月22前后 , 武汉华大和武汉金域两家第三方机构的日检测量 , 已占武汉市总量的近1半 。 ICL成为抗疫战场上重要的幕后特种部队 。