成为造物主:如何利用合成生物学的神力( 二 )
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基因组编辑技术 , 是指对目标基因进行编辑或修饰 , 能够定向修改基因组的重要工具 。 由于合成生物学对于DNA等遗传物质的合成、组装和编辑等操作均有关键需求 , 因此强大的基因编辑技术也是合成生物行业整体发展的重要前提 。
基因编辑技术分为三代 , 分别为ZFN、TALEN和CRISPR/Cas9 。 前两代技术采用的是蛋白质—DNA的识别模式 , 导致切割位点有较高的特异性 , 无法随心所欲的选择切割位点 , 且分别存在构建难度大和易于脱靶 , 或是操作繁琐的缺陷 。
CRISPR/Cas9:CRISPR全称为规律成簇的间隔短回文重复(ClusteredRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats) , 是原核生物基因组内的一段重复序列 , 大多数细菌及古细菌中的一种获得性免疫方式 。 Cas9则指的是一种CRISPR相关蛋白(即Cas) , 充当“分子剪刀” , 在引导RNA指定的位置切割DNA 。 2020年的诺贝尔化学奖正是颁给了贡献这一发现的科学家 。
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相较于前辈 , CRISPR/Cas9采用的是RNA-DNA的识别模式 , 切割位点的选择上更为广泛 , 且操作简便 , 周期短 , 成本低 , 调控方式多样化 。 凭借这些优势 , CRISPR/Cas9已经成为应用最为广泛的基因组编辑工具 。
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大规模基因组DNA设计和合成的相关技术 , 是改造细胞或创造人工生命的基础 。 早期的柱式合成不但成本高 , 通量也比较低 , 尚不能支撑合成生物产业的快速发展 。 但之后的芯片合成技术和超高通量芯片合成技术 , 已经能够实现在节省试剂的同时 , 进行大规模高通量合成 , 显著提升基因合成效率 , 且成本仅有旧式柱式合成技术的万分之一到百分之一 , 只是仍有合成工艺要求严格 , 会产生污染性有机化学废弃物等缺陷[6] 。 而最新一代的酶促合成技术则兼具作用条件温和 , 合成准确性高 , 副产物少等优点 , 颇具潜力但相比较之下仍处早期阶段 , 不够成熟 。
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高通量:指一次可检测多个样本或对同一样本进行多种检测的技术 。
引物:是指在核苷酸聚合作用起始时 , 一种具有特定核苷酸序列并能刺激合成的大分子 , 与反应物以氢键形式连接 , 这样的分子称为引物 。 体外人工设计的引物被广泛用于聚合酶链反应、测序和探针合成等 。
下游
由于合成生物学覆盖行业广泛 , 产业链公司也表现出了高度多样化的特征 , 总体可分为平台型与产品型两大类 。 平台型公司更注重对菌株的改造 , 致力于模块化与通用化;产品型公司则主要关注发酵以及后续环节 , 旨在实现规模化生产 , 以及解决后续的销售渠道 , 确立商业模式等更具体的落地问题 。
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不同类型的合成生物公司范例图源丨果壳硬科技[7]
这两类公司并无优劣之分 。 从产业角度讲 , 平台型公司主要提供主要技术支持 , 而产品型公司则推出产品并解决关键的商业化问题;从投资角度看 , 具备规模生产能力的产品型企业商业化能力更强 , 中短期内的确定性更高;而平台型公司则关乎整个行业的长期发展能力 , 需要有足够强的研发能力持续满足不断迭代的产品需求 , 具备此种特质的企业从中长期的视角看 , 更具成长性 。
值得一提的是 , 这两类公司也没有绝对界限 , 可以相互转化 。 平台型公司同样可以凭借自有技术开发相应产品;产品型公司也可向上回溯 , 开发技术平台 。 例如知名的合成生物Amyris和Zymergen都是平台公司 , 但也推出产品(关于这两家公司的故事将在下文讲述) 。
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