作一次基因测序要多少钱?( 四 ) _无创dna大概需要多少钱

2．pGEM-3Zf (+) 双链DNA对照模板 0.2g/L，试剂盒配套试剂。
3．M13(-21)引物 TGTAAAACGACGGCCAGT，3.2μmol/L，即3.2pmol/μl，试剂盒配套试剂。
4．DNA测序模板可以是PCR产物、单链DNA和质粒DNA等。模板浓度应调整在PCR反应时取量1μl为宜。本实验测定的质粒DNA，浓度为0.2g/L，即200ng/μl 。
5．引物需根据所要测定的DNA片段设计正向或反向引物，配制成3.2μmol/L，即3.2pmol/μl 。如重组质粒中含通用引物序列也可用通用引物，如M13(-21)引物，T7引物等。
6．灭菌去离子水或三蒸水。
7．0.2ml或和0.5ml的PCR管盖体分离，PE公司产品。
8．3mol/L 醋酸钠(pH5.2) 称取40.8g NaAc·3H2O溶于70ml蒸馏水中，冰醋酸调pH至5.2，定容至100ml，高压灭菌后分装。
9．70%乙醇和无水乙醇。
10．NaAc/乙醇混合液取37.5ml无水乙醇和2.5ml 3mol/L NaAc混匀，室温可保存1年。
11．POP 6测序胶 ABI产品。
12．模板抑制试剂(TSR) ABI产品。
13．10×电泳缓冲液 ABI产品。
14．ABI PRISM 310型全自动DNA测序仪。
15．2400型或9600型PCR仪。
16．台式冷冻高速离心机。
17．台式高速离心机或袖珍离心机。
【操作步骤】
1．PCR测序反应
(1) 取0.2ml的PCR管，用记号笔编号，将管插在颗粒冰中，按下表加试剂：
所加试剂测定模板管标准对照管
BigDye Mix1μl1μl
待测的质粒DNA1μl－
pGEM-3Zf (+) 双链DNA－ 1μl
待测DNA的正向引物1μl－
M13(-21)引物－ 1μl
灭菌去离子水2μl2μl
总反应体积5μl，不加轻矿物油或石蜡油，盖紧PCR管，用手指弹管混匀，稍离心。
(2) 将PCR管置于9600或2400型PCR仪上进行扩增。98℃变性2min后进行PCR循环，PCR循环参数为96℃ 10s，50℃ 5s，60℃4min，25个循环，扩增结束后设置4℃保温。
2．醋酸钠/乙醇法纯化PCR产物
(1) 将混合物离心，将扩增产物转移到1.5ml EP管中。
(2) 加入25μl醋酸钠/乙醇混合液，充分振荡，置冰上10min以沉淀DNA 。12 000r/min于4℃离心30 min，小心弃上清。
(3) 加70%(V/V)的乙醇50μl洗涤沉淀2次。12 000r/min于4℃离心5min，小心弃上清和管壁的液珠，真空干燥沉淀10～15min 。
3．电泳前测序PCR产物的处理。
(1) 加入12μl的TSR于离心管中，剧烈振荡，让其充分溶解DNA沉淀，稍离心。
(2) 将溶液转移至盖体分离的0.2ml PCR管中，稍离心。
(3) 在PCR仪上进行热变性(95℃ 2min)，冰中骤冷，待上机。
4．上机操作按仪器操作说明书安装毛细管，进行毛细管位置的校正，人工手动灌胶和建立运行的测序顺序文件。仪器将自动灌胶至毛细管，1.2kV预电泳5min，按编程次序自动进样，再预电泳(1.2kV，20min)，在7.5kV下电泳2h 。电泳结束后仪器会自动清洗，灌胶，进下一样品，预电泳和电泳。每一个样品电泳总时间为2.5h 。电泳结束后仪器会自动分析或打印出彩色测序图谱。
5．仪器将自动进行序列分析，并可根据用户要求进行序列比较。如测序序列已知，可通过序列比较以星号标出差异碱基处，提高工作效率。
6．测序完毕按仪器操作规程进行仪器清洗与保养。
【计算】
测序反应精确度计算公式：100%－差异碱基数(不包括N数)/650×100%
差异碱基即测定的DNA序列与已知标准DNA序列比较不同的碱基，N为仪器不能辨读的碱基。
【注意事项与评价】
1．ABI PRISM 310基因分析仪是高档精密仪器，需专人操作、管理和维护。
2．本实验测序PCR反应的总体积是5μl，而且未加矿物油覆盖，所以PCR管盖的密封性很重要，除加完试剂后盖紧PCR管盖外，最好选用PE公司的PCR管。如PCR结束后PCR液小于4～4.5μl，则此PCR反应可能失败，不必进行纯化和上样。
3．作为测序用户来说，只需提供纯化好的DNA样品和引物，一个测序PCR反应使用的模板不同，需要的DNA量也就不同，PCR测序所需模板的量较少，一般PCR产物需30～90ng，单链DNA需50～100ng，双链DNA需200～500ng，DNA的纯度一般是A260nm/A280nm为 1.6～2.0，最好用去离子水或三蒸水溶解DNA，不用TE缓冲液溶解。引物用去离子水或三蒸水配成3.2pmol/μl较好。
4．本实验使用的测序试剂盒是BigDye荧光标记终止底物循环测序试剂盒，一般可测DNA长度为650bp左右。本仪器DNA测序精确度为 (98.5±0.5) %，仪器不能辨读的碱基N＜2%，所需测定的长度超过了650bp，则需设计另外的引物。为保证测序更为准确，可设计反向引物对同一模板进行测序，相互印证。对于N碱基可进行人工核对，有时可以辨读出来。为提高测序的精确度，根据星号提示位置，可人工分析该处彩色图谱，对该处碱基作进一步核对。
DNA测序仪已发展到第几代了？什么时候人们才开始关注DNA测序的？国内外的DNA测序仪发展的现状？测序仪市场在用的，到第三代测序仪。