从公有云到专有云,云计算如何升级基因行业?
原标题:从公有云到专有云 , 云计算如何升级基因行业?
自2000年全球合作十年完成首个人类基因组图谱的绘制以来 , 测序技术已经更新了四代 。 测序通量从开始的几个碱基发展到了一次几个Tb 。 2009年 , 二代高通量测序技术逐渐走向成熟和市场化 , 基因的概念也逐渐被广大普通百姓所熟知 , 应用领域从生育健康到遗传病诊断再到肿瘤基因早筛和个人基因组测序 。
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基因行业的痛点
随着测序成本的降低 , 测序通量越来越高 , 产生的数据越来越多 , 目前主流二代高通量测序仪单次最高日产出数据已经达到6Tb 。 行业应用也不断升级 , 遗传病的检测已经开始由WES向数据量更大信息更全的WGS转变 , 肿瘤基因检测动辄上千个基因的大panel 。 在数据量不断提高和应用不断升级的过程中行业应用面临如下几个痛点:
1.基础性硬件资源
随着测序通量的不断提升数据规模呈现指数级别增长 , 同时随着三代测序的普及测序长度也越来越长 , 这给服务器的存储和计算能力及网络的传输能力带来了极大的挑战 , 但是另一方面随着应用技术的不断发展 , 测序技术已经从单纯的科研服务走向以生育、遗传病和肿瘤为代表的临床应用 , 对于分析速度要求越来越高 , 现在一份临床肿瘤基因检测报告会在7天之内送到患者手中 , 如何解决硬件资源的短缺和交付周期不断缩短的矛盾成为基因行业内企业普遍存在的问题 。
2.合规性问题
2019年 , 国务院颁布了《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》对人类遗传资源的采集、保藏、利用和对外合作等方面提出了要求 。 基因数据作为重要的遗传资源是重点审查内容 , 每年相关部门都会对行业内企业做监督审查 , 对一些不合规内容要求整改 , 包括本地服务器等保认证、公有云使用情况等 。 合规性问题已经成为基因行业特别是从事第三方临床基因检测企业必须首先要考虑的问题 。
3.IT硬件运维问题
随着基因行业企业的不断发展与扩大 , IT硬件资源的运维也面临各种各样的问题 , 首先是人员问题 , 本地维护人员短缺 , 很多公司没有专门的运维人员 。 其次是成本问题 , 本地运维需要支出电费、人员成本、各种等保认证安全认证服务等 , IT运维成本较高 。 产业园区内企业可能还会面临来自园区的各种限制 , 比如场地不足、不能使用大功率设备等问题 。
4.数据安全性问题
由于基因行业数据往往涉及到的是患者信息、临床信息、基因信息等敏感信息 , 如何确保这些数据存放在本地的服务器、或者云端而不丢失、扩散一直是每个基因行业内企业关注的问题 。
云计算行业和基因行业虽然是两个不同的行业 , 但是都是在2010年左右得到飞速发展 。 对于基因行业来说 , 云计算的发展促进了基因行业的快速发展 , BT+IT模式得到了广泛的应用 , 公有云厂商对于基因行业的大规模并行计算、数据交付等应用场景提供了便利 。 但是无论是私有云还是公有云都无法完全解决基因行业的以上痛点 。
近两年 , 随着云计算技术的发展 , 专有云作为一种新兴的云服务 , 受到了广泛的关注 。 作为国内知名的云服务厂商 , 有孚网络专注于为企业提供稳定、可靠的专有云服务 。 针对基因行业的现状和痛点 , 有孚提供了完整解决方案:
1.数据存储及归档
针对基因行业存储资源的不足 , 提供了对象存储、文件分布式存储、块存储等多种数据存储方式 , 支持热温冷不同数据分层管理 , 缓存模式下 , 自动根据数据的热度实现数据本地和云端的分层 , 满足海量数据存储需求 , 也支持数据分发、数据归档等多个场景 。
2.高性能、稳定弹性计算
针对基因行业的计算资源不足 , 提供弹性云服务器;针对原始下机测序数据解析和三代测序数据 , 我们提供专门的GPU云服务器等计算实例和裸金属服务器 。
3.数据传输及数据安全
如何将测序数据传到云端?提供专网专线接入 , 包括但不限于电信、联通、移动、教育、BGP等网络服务 , 享受低延迟和高带宽 , 保证海量基因数据的稳定传输;同时 , 与公网完全隔绝、无数据泄漏风险 , 实现高速、可靠和安全的数据传输 。
4.专业的数据中心托管服务
针对基因行业普遍缺少合规的服务器管理服务 , 缺乏服务器运维人员 。 有孚网络依托自身在北京、上海、深圳的高等级数据中心资源为基因行业提供合规的、安全的服务器托管与运维服务 。
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